Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD33P20138 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD33P20138 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD33P20138 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms