Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A1P19634 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms