Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DESP17661 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DESP17661 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DESP17661 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DESP17661 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DESP17661 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms