Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYN1P17600 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYN1P17600 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYN1P17600 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYN1P17600 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYN1P17600 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYN1P17600 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYN1P17600 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYN1P17600 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYN1P17600 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYN1P17600 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN1P17600 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN1P17600 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN1P17600 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms