Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms