Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CREB1P16220 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CREB1P16220 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CREB1P16220 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB1P16220 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms