Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A1P13866 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms