Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT10P13645 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT10P13645 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT10P13645 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT10P13645 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT10P13645 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT10P13645 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT10P13645 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT10P13645 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT10P13645 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT10P13645 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT10P13645 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT10P13645 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT10P13645 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT10P13645 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT10P13645 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT10P13645 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT10P13645 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT10P13645 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT10P13645 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms