Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG2P13521 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG2P13521 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG2P13521 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG2P13521 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG2P13521 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG2P13521 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG2P13521 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms