Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARBP10826 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARBP10826 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARBP10826 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARBP10826 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARBP10826 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARBP10826 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARBP10826 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARBP10826 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARBP10826 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms