Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HKR1P10072 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HKR1P10072 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HKR1P10072 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HKR1P10072 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HKR1P10072 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HKR1P10072 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HKR1P10072 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms