Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms