Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI1P08151 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI1P08151 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI1P08151 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI1P08151 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI1P08151 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI1P08151 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI1P08151 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI1P08151 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI1P08151 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI1P08151 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI1P08151 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI1P08151 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI1P08151 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI1P08151 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI1P08151 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI1P08151 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI1P08151 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI1P08151 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI1P08151 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI1P08151 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms