Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NGFRP08138 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NGFRP08138 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NGFRP08138 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NGFRP08138 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NGFRP08138 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms