Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms