Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CLDN9O95484 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLDN9O95484 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLDN9O95484 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLDN9O95484 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLDN9O95484 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLDN9O95484 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLDN9O95484 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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CLDN9O95484 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CLDN9O95484 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CLDN9O95484 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CLDN9O95484 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CLDN9O95484 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CLDN9O95484 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CLDN9O95484 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CLDN9O95484 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CLDN9O95484 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CLDN9O95484 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN9O95484 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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