Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F6O75461 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F6O75461 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F6O75461 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F6O75461 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms