Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTNSO60931 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTNSO60931 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CTNSO60931 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNSO60931 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNSO60931 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNSO60931 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNSO60931 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms