Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMFO60524 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMFO60524 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMFO60524 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMFO60524 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEMFO60524 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEMFO60524 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEMFO60524 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEMFO60524 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEMFO60524 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEMFO60524 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEMFO60524 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEMFO60524 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEMFO60524 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEMFO60524 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms