Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms