Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3APO60318 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MCM3APO60318 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms