Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP9BO43861 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP9BO43861 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms