Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms