Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms