Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms