Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN4O43707 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms