Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ3O43525 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms