Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD28O15084 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms