Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms