Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF646O15015 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms