Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IKBKBO14920 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms