Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
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