Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CDO00329 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms