Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8SH3BPF8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms