Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB9F8W1W9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms