Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms