Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-1B6SEH8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-1B6SEH8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms