Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A8MVJ9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A8MVJ9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A8MVJ9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A8MVJ9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A8MVJ9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A8MVJ9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MVJ9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MVJ9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MVJ9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A8MVJ9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
A8MVJ9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
A8MVJ9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A8MVJ9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
A8MVJ9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms