Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD3A6NKT7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms