Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms