Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms