Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F8A0AVK6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms