Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N3

TRBV24-1, T-cell receptor beta variable 24-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV24-1A0A075B6N3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TRBV24-1A0A075B6N3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TRBV24-1A0A075B6N3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TRBV24-1A0A075B6N3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TRBV24-1A0A075B6N3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TRBV24-1A0A075B6N3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TRBV24-1A0A075B6N3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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TRBV24-1A0A075B6N3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV24-1A0A075B6N3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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