Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
V9GY48 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
V9GY48 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
V9GY48 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
V9GY48 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GY48 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
V9GY48 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
V9GY48 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GY48 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GY48 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GY48 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GY48 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GY48 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GY48 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GY48 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GY48 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GY48 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GY48 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GY48 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GY48 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GY48 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms