Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCOA3Q9Y6Q9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms