Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN6Q9Y6Q1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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