Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG6Q9Y2V7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG6Q9Y2V7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms