Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1DQ9Y2S0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms