Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NINLQ9Y2I6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NINLQ9Y2I6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms