Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC47.25■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC47.25■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC47.25■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC47.25■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC47.24■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.24■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.24■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC47.23■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC47.22■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC47.22■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC47.21■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC47.2■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.15
NISCHQ9Y2I1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
NISCHQ9Y2I1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC47.15■■■■■ 5.14
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